La paleogenómica en el estudio de las enfermedades: avances y limitaciones.

Abstract

En la última década, la implementación de las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento ha producido un avance notable en los estudios de ADN antiguo. Esta mejora metodológica ha permitido, por primera vez, obtener información fiable sobre los agentes infecciosos causantes de brotes epidémicos del pasado, además de ofrecer una oportunidad única para revelar linajes microbianos hasta ahora desconocidos. Poner en contexto el estudio de genomas de patógenos antiguos en una escala cronológica es importante para desentrañar la historia evolutiva de las enfermedades, y cómo éstas han influido en la historia de la Humanidad. En los últimos años se han publicado numerosos trabajos sobre el estudio a escala genómica de patógenos antiguos (bacterias, virus y patógenos protozoarios) que han aportado información valiosa al estudio de la transmisión de agentes infecciosos. Dada su relevancia en la actualidad, en este trabajo se hará una revisión bibliográfica de los análisis de patógenos recuperados de restos antiguos a través de técnicas paleogenómicas. Para ello, se examinarán los estudios paleogenómicos de dos de los agentes infecciosos con mayor relevancia de los últimos tiempos. Por una parte, se analizará el agente etiológico de la peste bubónica, Yersinia pestis, un patógeno que ha provocado varias pandemias a lo largo de la historia de la humanidad. Por último, se examinarán los últimos estudios de Plasmodium vivax y Plasmodium falciparum, ambos patógenos causantes de la malaria, presentes en Europa hasta mediados del siglo XX, y aún problemáticos en gran parte de América, África y Asia en la actualidad.

In the last decade, the implementation of next-generation sequencing technologies has produced a remarkable advance in ancient DNA studies. This methodological improvement has made it possible, for the first time, to obtain reliable information on the infectious agents that cause epidemic outbreaks in the past, as well as offering a unique opportunity to reveal unknown microbial lineages. Contextualizing the study of ancient pathogen genomes on a time scale is important to unraveling the evolutionary history of diseases, and how they have influenced human history. In recent years, numerous studies have been published on the genomic-scale analysis of ancient pathogens (bacteria, viruses and protozoan pathogens) that have provided valuable information on the transmission of infectious agents. Given its relevance today, the this work will focus on performing a bibliographic review of the paleogenomic analyses of pathogens recovered from ancient remains. For that, we will examine the palaeogenomic characterization of two of the most relevant infectious agents in recent times. First, we will review the etiological agent of the bubonic plague, Yersinia pestis, a pathogen that has caused several pandemics throughout human history. Second, we will examine the latest studies of Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum, both pathogens that cause malaria, present in Europe until the middle of the 20th century, and still problematic in much of America, Africa and Asia nowadays.